More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1232 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  100 
 
 
164 aa  320  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  100 
 
 
164 aa  320  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  100 
 
 
164 aa  320  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  100 
 
 
164 aa  320  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  100 
 
 
164 aa  320  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  100 
 
 
164 aa  320  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  95.12 
 
 
164 aa  308  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  70.55 
 
 
163 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  69.86 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  68.24 
 
 
167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  62.03 
 
 
167 aa  190  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  68.59 
 
 
167 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  54.37 
 
 
187 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  60.14 
 
 
168 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  57.79 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  49.02 
 
 
156 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  48.63 
 
 
156 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  48.98 
 
 
157 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 
153 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  47.02 
 
 
155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  46.79 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  46.9 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  46.36 
 
 
155 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  46.36 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  46.36 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  46.36 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  46.36 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  48.3 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  46.36 
 
 
155 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  48.3 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  46.21 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  47.95 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  50 
 
 
157 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  48.05 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  46.15 
 
 
155 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  47.74 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  47.95 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  44.87 
 
 
155 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  45.45 
 
 
151 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  45.45 
 
 
151 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  46.58 
 
 
152 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  46.75 
 
 
151 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 
158 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  46.21 
 
 
200 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  46.21 
 
 
156 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  46.21 
 
 
156 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  46.21 
 
 
156 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  46.21 
 
 
156 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  46.21 
 
 
156 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  46.75 
 
 
156 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  46.9 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  45.52 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  44.44 
 
 
156 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  46.58 
 
 
184 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  40.62 
 
 
166 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  38.89 
 
 
166 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  38.89 
 
 
166 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  43.54 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 
150 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  45.89 
 
 
201 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  45.89 
 
 
191 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  45.89 
 
 
201 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  45.89 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  45.89 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  45.89 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 
318 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  43.84 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  90.5  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.24 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.75 
 
 
151 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.49 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  44.67 
 
 
156 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 
156 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.86 
 
 
149 aa  88.2  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
155 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  40.41 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  39.6 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.86 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  37.8 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  42.14 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  39.04 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.33 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  38.78 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.57 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>