More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1300 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1300  universal stress protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  88.89 
 
 		 145 aa  196  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  88.89 
 
 		 145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  39.56 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  44.87 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  43.53 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  37.96 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  48 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  40 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  41.56 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  39.51 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  42.31 
 
 		 390 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  58.49 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  55.74 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  40 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  48.48 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40.26 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  39.22 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  48.48 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  40.51 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  37.35 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.02 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  39.74 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  49.21 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.96 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  45.57 
 
 		 317 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.62 
 
 		 300 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.03 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  58.49 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.67 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.28 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  53.12 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  37.35 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  39.74 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  34.78 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  42.11 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  37.5 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  40.58 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.88 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  44.78 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.59 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  45.16 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  38.67 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  33.63 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.8 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  58.49 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  43.94 
 
 		 307 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  40.91 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  44.29 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  50 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  44.78 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  50 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  43.33 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  43.08 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  42.42 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  35.11 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  50 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  46.43 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  40 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  35.64 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  54.55 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  42.19 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.35 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  35.64 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  35.85 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  35.64 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  41.67 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.3 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  46.43 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  48 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  38.1 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  52 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  37.88 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  33.33 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  40.58 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.94 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  52 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  37.68 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.38 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.78 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.76 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36.05 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  45.45 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  39.36 
 
 		 154 aa  57  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  36.9 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>