More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1678 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  39.86 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  37.97 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  36.7 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  35.59 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  36.39 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  28.09 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  29.39 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  29.93 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  29.73 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.67 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  33.01 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  30.9 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  28.14 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  26.01 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  30.41 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  30.07 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  29.59 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  30.1 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.57 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  29.01 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  28.12 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  27.09 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  26.43 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  26.46 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.73 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.94 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  28.24 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.01 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  26.87 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  27.8 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  27.83 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  26.04 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.06 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  28.43 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  28.4 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  24.53 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.41 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  26.78 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  25.63 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.42 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.17 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  27.95 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  26.35 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  24.51 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.02 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  23.7 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.57 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  24.21 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  26.12 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  29.5 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  32.47 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  25.36 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  25.82 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  33.77 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.42 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  23.38 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.29 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  25.89 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  25.77 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.04 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3607  hypothetical protein  28.19 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.48 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.77 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.88 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  25.94 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  28.22 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  25.89 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  24.62 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.91 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  25.23 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  25.17 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.66 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  33.33 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.41 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  29.53 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.41 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  24.12 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  32.64 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  32.64 
 
 		 140 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>