More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3607 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3607  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  69.68 
 
 		 301 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  67.53 
 
 		 295 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 		 289 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  39.86 
 
 		 309 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.08 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  31.08 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  33.1 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.78 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.33 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  28.19 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  29.73 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  31.69 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.66 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.11 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  29.73 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.34 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  30.07 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.76 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.04 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.21 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.38 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  30.41 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  32.14 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.38 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  31.1 
 
 		 311 aa  54.7  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.27 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.82 
 
 		 289 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  30.12 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  27.08 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.01 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  33.33 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.65 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.62 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  31.03 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1184  hypothetical protein  35.24 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  46 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.85 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  36.51 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  53.19 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.67 
 
 		 307 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  32.14 
 
 		 108 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  35.37 
 
 		 297 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  47.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  47.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  47.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  53.19 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  47.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  29.79 
 
 		 303 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  47.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  47.27 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.41 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  50 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  50 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  50 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  50 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  50 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  50 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 282 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.75 
 
 		 280 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  53.19 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  55.81 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  33.33 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  46.55 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  40.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  40.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  31.85 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  41.18 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  24.63 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  29.37 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  40.28 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  39.19 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  45.45 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.9 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.43 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  27.27 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  32.56 
 
 		 296 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  24.65 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  45.61 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  33.76 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  46.15 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>