290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2148 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30.38 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  29.8 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  32.43 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  29.32 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  28.34 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.32 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  30.49 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  28.34 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  30.59 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.93 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  28.47 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  29.22 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.75 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  29.83 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.08 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.3 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.21 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.08 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  32.76 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  27.65 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  31.06 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.05 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.48 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  27.7 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.29 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  28.57 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.89 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.89 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.29 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.48 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  28.28 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.72 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  24.76 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.33 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.89 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  32.19 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.49 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.19 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  29.26 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  29.41 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  21.71 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.16 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.16 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.35 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.47 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.52 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.91 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  32.39 
 
 		 149 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  19.59 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.13 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.21 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25.5 
 
 		 164 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  32.24 
 
 		 158 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  23.65 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  32.24 
 
 		 160 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  23.37 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  30.65 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  27.56 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.89 
 
 		 180 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.21 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  27.92 
 
 		 147 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.97 
 
 		 154 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  28.76 
 
 		 147 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 143 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34.67 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>