195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  96.68 
 
 		 271 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  49.08 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  39.36 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.05 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  30.88 
 
 		 286 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  30.18 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  33.22 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  31.33 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.67 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  29.47 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.6 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.36 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.67 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  25.6 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  29.15 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  27.59 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.83 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  28.91 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  27.5 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  29.95 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1338  UspA domain protein  28.32 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0244136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  26.71 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.99 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27.12 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.21 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.42 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.61 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  23.89 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  24.15 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  24.75 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  28.75 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.96 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  30.05 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  24.73 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  25 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  25.77 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.36 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  30.05 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  27.15 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  25.26 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.77 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  24.92 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.78 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  29.88 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  23.92 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  26.26 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  24.88 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.11 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  24.47 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 151 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  24.1 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  25.59 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  27.24 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  20.07 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  24.75 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.61 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  26.24 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 142 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  21.35 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  26.39 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  25.54 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  26.17 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  24.17 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  27.76 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 		 318 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.27 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  23.2 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.54 
 
 		 150 aa  48.9  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.17 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.43 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  23.62 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  31.79 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  25.97 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  25.97 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  25.97 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.57 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  25.76 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.91 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  26.24 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  32.43 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  27.4 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  27.4 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  25.08 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  23.93 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 162 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  27.4 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>