232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0245 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0245  universal stress protein  100 
 
 		 370 aa  764    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.97 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.12 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.82 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  21.68 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.58 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.91 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  24.48 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  23.75 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  24.89 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  24.32 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.22 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  23.99 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.93 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30 
 
 		 140 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 145 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  20.91 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  28.99 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  25.33 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  28.22 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.35 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 145 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  23.91 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  24.36 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.92 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  25.49 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  24.5 
 
 		 153 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.74 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.26 
 
 		 170 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  30.52 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.26 
 
 		 170 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.15 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  23.84 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  24.55 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  28.95 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.4 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 145 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30 
 
 		 148 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.92 
 
 		 149 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  22.36 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  27.39 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  23.2 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.81 
 
 		 165 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30.92 
 
 		 169 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  21.56 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  26.71 
 
 		 158 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  26.11 
 
 		 160 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  23.84 
 
 		 151 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  22.77 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.63 
 
 		 145 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  39.71 
 
 		 141 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1035  UspA domain protein  21.21 
 
 		 293 aa  53.1  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  39.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 151 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  18.24 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  23.08 
 
 		 161 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  22.18 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 145 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 143 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  27.15 
 
 		 146 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  26.62 
 
 		 149 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  26 
 
 		 146 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  21.84 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  23.55 
 
 		 271 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  25.49 
 
 		 147 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  20.88 
 
 		 277 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 140 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 138 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  24.18 
 
 		 147 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.26 
 
 		 141 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  21.31 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  22.67 
 
 		 264 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  25.49 
 
 		 145 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  23.18 
 
 		 283 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  42.62 
 
 		 120 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.8 
 
 		 152 aa  49.7  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  24.11 
 
 		 300 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.67 
 
 		 140 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 162 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.67 
 
 		 287 aa  49.7  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.1 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.8 
 
 		 149 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  22.22 
 
 		 151 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  28.21 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  23.72 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  19.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.86 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  24.87 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  22.77 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.48 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  22.79 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>