238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1265 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  22.71 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  22.69 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  25.62 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  28.4 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.73 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.89 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  21.2 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.09 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  20.7 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  27.94 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  20.09 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  23.39 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  21.36 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  22.37 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  25.13 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  20.18 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.79 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  24.09 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  25.78 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.33 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  20.23 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  20 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  19.56 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  22.13 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  28.77 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30.82 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.29 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  22.92 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  21.86 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.86 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  24.88 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  22.48 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  21.79 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  19.59 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.08 
 
 		 147 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.87 
 
 		 142 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  25.16 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  20.54 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  22.95 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  21.51 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  25 
 
 		 170 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.4 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  25 
 
 		 170 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  27.13 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  22.22 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.4 
 
 		 149 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  21.69 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  22.54 
 
 		 149 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  23.84 
 
 		 150 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  23.08 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  25 
 
 		 142 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  19.89 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  23.85 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  22.04 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.86 
 
 		 142 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  24.32 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  24.67 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  22.6 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.53 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.28 
 
 		 415 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.45 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  24.49 
 
 		 153 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  21.53 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  20.95 
 
 		 167 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  26.43 
 
 		 154 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  25.9 
 
 		 151 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  23.64 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.77 
 
 		 151 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  24.32 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  21.8 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  30.15 
 
 		 143 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 145 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  20.27 
 
 		 162 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  22.73 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  23.13 
 
 		 156 aa  48.9  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  25.18 
 
 		 146 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.47 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.77 
 
 		 149 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  23.7 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  22.45 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  22.38 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  20.5 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.44 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  26.21 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  24.66 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  24.66 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.2 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>