138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6021 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  100 
 
 		 352 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  41.73 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  41.37 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30.95 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.85 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 289 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  30.61 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.01 
 
 		 306 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  31.06 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  28.78 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  29.79 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.87 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  30.26 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  29.79 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.46 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  26.04 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  28.42 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.27 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  29.27 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.32 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  25.98 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  27.43 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.99 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.16 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.93 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.11 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6013  GreA/GreB family elongation factor  73.81 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.886926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  26.87 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.57 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.35 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  33.51 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  28.42 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.93 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  25.89 
 
 		 285 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.87 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  28.95 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.99 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  33.16 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  33.16 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  29.63 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 145 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  28.19 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 162 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  26.62 
 
 		 157 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.04 
 
 		 173 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  27.35 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.07 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.05 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  33.16 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  26.62 
 
 		 157 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  25.69 
 
 		 149 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  25.81 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  30.46 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.62 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.97 
 
 		 143 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  28.42 
 
 		 271 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  24.48 
 
 		 307 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  24.07 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  30.81 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  23.64 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  22.91 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  23.64 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  25.15 
 
 		 166 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  26.39 
 
 		 177 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.77 
 
 		 287 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.18 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 167 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 163 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.28 
 
 		 152 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  27.93 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  23.83 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  26.35 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  26.35 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  26.35 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  26.35 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  26.35 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.18 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  27.52 
 
 		 151 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 163 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.06 
 
 		 153 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  23.24 
 
 		 151 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  25.69 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  26.35 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  26.85 
 
 		 151 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  26.92 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  27.63 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  27.63 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>