294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2427 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  53.43 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  30.77 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  29.84 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  27.11 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  29.53 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  30.98 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  29.75 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  23.7 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  28.57 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  26.4 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.12 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  26.03 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  26.17 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  24.07 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.63 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.68 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.73 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  24.64 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  24.32 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.91 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.37 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  25.23 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.19 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  25.91 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  28.09 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  35.29 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  26.2 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  28.87 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.34 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.43 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.43 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.69 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  24.48 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  25 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.14 
 
 		 169 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 157 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  22.69 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  28.09 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  28.15 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  36.05 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  26.25 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  32.18 
 
 		 164 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  21.43 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  32.18 
 
 		 164 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 145 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.46 
 
 		 159 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  26.89 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  32.53 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  26.91 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.59 
 
 		 150 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.47 
 
 		 147 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  26.83 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.74 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  27.08 
 
 		 166 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 		 412 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.58 
 
 		 147 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  25.21 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  23.53 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.48 
 
 		 515 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  25.53 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.57 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.09 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  37.23 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  23.98 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  23.08 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  26.62 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  25.52 
 
 		 150 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  25 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.49 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  33.07 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  27.33 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  26.9 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.93 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  26.79 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  23.73 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.12 
 
 		 142 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.9 
 
 		 162 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  20.73 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  25 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.55 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 151 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.92 
 
 		 154 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>