289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4990 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  100 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  27.68 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  25.44 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.21 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.32 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  27.68 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.14 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  27.24 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  24.32 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  32.89 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  35.29 
 
 		 142 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  24.21 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  24.57 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  23.13 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.53 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.37 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  25.17 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.58 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.18 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  24.43 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  26.47 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  24.19 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.52 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  25 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.52 
 
 		 153 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.49 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  25.09 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  29.59 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.67 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  21.53 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  30.2 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  23.13 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.96 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  28.07 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  24.41 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.24 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  29.41 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  25.73 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.76 
 
 		 162 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  23.05 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  24.83 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.18 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  24.89 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  29.44 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.51 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  23.28 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 143 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  29.22 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25.38 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 		 172 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  22.53 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  33.77 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.68 
 
 		 177 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  24.73 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 139 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 162 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.8 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25.25 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 449 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.9 
 
 		 159 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  26.67 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 159 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 175 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 188 aa  52.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  27.81 
 
 		 157 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  22.87 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  26.45 
 
 		 182 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.68 
 
 		 150 aa  52.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  26.45 
 
 		 182 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 147 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.95 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  25.77 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  29.94 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  28.38 
 
 		 148 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  26.17 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  26.85 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  27.81 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.95 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  21.79 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.41 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  29.94 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  32.48 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  29.94 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  29.94 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  29.94 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  25 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  22.95 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  23.65 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  27.85 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  29.94 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>