33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5771 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  32.86 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  33.1 
 
 		 358 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  24.05 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  24.74 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  26.13 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  23.61 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  23.49 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  25.17 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  25.17 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  28.12 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.53 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  23.2 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.94 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  24.57 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.21 
 
 		 159 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  22.65 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  24.16 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  23.26 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  21.43 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.83 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  19.33 
 
 		 370 aa  48.9  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  25.23 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  23.18 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  22.18 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  24.84 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  24.53 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.54 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  24.14 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.26 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  22.18 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.72 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 148 aa  42.7  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>