More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3549 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  100 
 
 		 278 aa  567  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  40.86 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.77 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.39 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  30.39 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  30.21 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  27.62 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  25.95 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  25.44 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  34.81 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.77 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.17 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  28.12 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.34 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.6 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.4 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.24 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.87 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  27.65 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  27.46 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.24 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25.42 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  29.73 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.71 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.57 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.24 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.24 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.08 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.39 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.95 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.24 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.81 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  21.71 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.19 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.08 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.92 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  31.79 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.68 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  24.92 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.39 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.3 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.6 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.08 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.89 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.48 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  31.1 
 
 		 175 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.1 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  22.58 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  22.41 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  27.91 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27.54 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  26.71 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  56.25 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  37.01 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  26.16 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.51 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.61 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.61 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  25.75 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  27.85 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  22.88 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  24.27 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.59 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.53 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.23 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  26.91 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.29 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  28.57 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  25.66 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.33 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.3 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  22.64 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.82 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  22.26 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  26.67 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  22.26 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  28.97 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>