More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3570 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  100 
 
 		 271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  40.86 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.52 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  34.29 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.71 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.41 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  30.39 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  28.78 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  27.84 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.68 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  28.07 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25.75 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.23 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.22 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  27.91 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  26.18 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  27.36 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  30.2 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.42 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.42 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  38.71 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  36.84 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  26.91 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.96 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.23 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  22.54 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  19.78 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  24.29 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.21 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.23 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.96 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  33.55 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.48 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  33.12 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  25.17 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  26.27 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.4 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  29.27 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.27 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  29.27 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  29.27 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.33 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.95 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.66 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  28.43 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  34.46 
 
 		 141 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.37 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.38 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.45 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.08 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  29.61 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.61 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  25.6 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  26.42 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.82 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  22.11 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  26.3 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  26.51 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  24.32 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.69 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.74 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  23.65 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  25.2 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  25.41 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.88 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  24.01 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  34.67 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.68 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  25.93 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25.85 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  23.2 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.3 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  24.67 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.34 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.43 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  29.29 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.28 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  26.46 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  26.32 
 
 		 153 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.22 
 
 		 157 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 145 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.22 
 
 		 157 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 143 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>