210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0547 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  27.68 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  23.94 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  33.11 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  33.79 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.14 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.97 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.82 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.97 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.97 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.03 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.89 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  29.73 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.21 
 
 		 152 aa  62  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.65 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  32.87 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.93 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  29.21 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  21.86 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.71 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  29.8 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  32.41 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  29.05 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  27.1 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.85 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.88 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  28.95 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.43 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.87 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  27.66 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 145 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  28.21 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  29.73 
 
 		 154 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  26.14 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  52.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.54 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 143 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  26.75 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  27.63 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  26.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  26.32 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  25.66 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 692 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 148 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 148 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 146 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  30.83 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  27.97 
 
 		 154 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 159 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 145 aa  49.3  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 145 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.34 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  29.53 
 
 		 151 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.67 
 
 		 154 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  27.15 
 
 		 152 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  28 
 
 		 147 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.4 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  30.67 
 
 		 143 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 140 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  23.97 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  29.8 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  31.47 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  31.47 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  25.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  25.95 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  28.97 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  29.58 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.8 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  27.03 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  32.65 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 160 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  27.08 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 155 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  32.17 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  30.12 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  27 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  25.69 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  27.59 
 
 		 140 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>