More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0401 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  72.86 
 
 		 140 aa  213  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  62.14 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  61.43 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  68.09 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  55.71 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  60.71 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  53.57 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  54.29 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  45 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  41.13 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  37.59 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  30.94 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.94 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  30.14 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  32.67 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  29.71 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.99 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.94 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  29.5 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.29 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  35.1 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  31.88 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.43 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.22 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.06 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  31.58 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  36.71 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  31.91 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  32.88 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.44 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.47 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.09 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.29 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.25 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.56 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  27.97 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.93 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  25.34 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  38.98 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  36.36 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  26.09 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.5 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  32.64 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.12 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  27.89 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.43 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  27.46 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  34.18 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  44.44 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  31.63 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.5 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  25.9 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  25.9 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  25.9 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  25.9 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  25.9 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  40.3 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.58 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.92 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.87 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  27.08 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.62 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.03 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.79 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  30.26 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  30.22 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.03 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.87 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 		 324 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>