More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1135 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  100 
 
 		 281 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  30.42 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  26.15 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.7 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.1 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.83 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  24.05 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  27.1 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  23.94 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  28.21 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.14 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  23.94 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  22.41 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  25.86 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  24.47 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  24.91 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  23.93 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.28 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  23.59 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  19.78 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  24.83 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  19.73 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  25.35 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  25.57 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  20.98 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.25 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  23.99 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  24.23 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  21.52 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  26.76 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  20.97 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  22.14 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.87 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  20.42 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  24.42 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  22.65 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  20.96 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.97 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  24.3 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  28.57 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  26.53 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  26.53 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.4 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 153 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  28.48 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  30.34 
 
 		 154 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  21.71 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  21.38 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  24.29 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  25 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.5 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  25 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  26.9 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  24.7 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  27.03 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  25 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.66 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  25.87 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  27.21 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  21.33 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.83 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  30.14 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  30.14 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  22.88 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  20.61 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25.17 
 
 		 145 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  28.03 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  25.64 
 
 		 162 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  26.43 
 
 		 146 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 140 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  28.67 
 
 		 143 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  21.9 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  25.48 
 
 		 162 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  22.95 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  23.18 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  24.5 
 
 		 142 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  22.22 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  23.26 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  25.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  25.85 
 
 		 140 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  20.21 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  19.38 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  23.08 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  20.27 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  25 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  22.71 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  25.83 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  24.13 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  24 
 
 		 151 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>