22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2459 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  48.71 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  25.98 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  26.45 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  28.78 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  29.17 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  24.91 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  24.82 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.66 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.66 
 
 		 149 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  27.14 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  24.12 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  26.71 
 
 		 148 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.66 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  24.23 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  23.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  28.21 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.72 
 
 		 301 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.97 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 		 145 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>