69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02880 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  22.14 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  28.57 
 
 
281 aa  72  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  22.22 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  25.36 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  20.59 
 
 
318 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 
140 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.62 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.35 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  21.74 
 
 
297 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
143 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.34 
 
 
139 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  23.64 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  24.47 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  26.06 
 
 
149 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.87 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  21.43 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  22.67 
 
 
370 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  18.48 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 
145 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  25.52 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3749  UspA domain-containing protein  20.71 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.074776  hitchhiker  0.000110577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 
140 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  25.36 
 
 
147 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.43 
 
 
320 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  22.02 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
153 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  23.19 
 
 
145 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.72 
 
 
283 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  21.58 
 
 
277 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  19.88 
 
 
293 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  30.28 
 
 
144 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  26.12 
 
 
276 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  26.43 
 
 
140 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  28.67 
 
 
165 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  24.45 
 
 
287 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  26.28 
 
 
280 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  24.64 
 
 
145 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  23.79 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  24.82 
 
 
180 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  31.71 
 
 
296 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.49 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  24.26 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  21.74 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  28.46 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  24.49 
 
 
139 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  23.98 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.57 
 
 
143 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  21.74 
 
 
148 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  20.21 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  25.5 
 
 
141 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.52 
 
 
287 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.38 
 
 
139 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0609  UspA domain protein  21.57 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.57 
 
 
164 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  23.6 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  25.69 
 
 
145 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  27.78 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  22.38 
 
 
140 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  21.26 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 
141 aa  42  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  19.85 
 
 
136 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  22.87 
 
 
295 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  23.96 
 
 
304 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  26.45 
 
 
141 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>