More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2016 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  70.75 
 
 		 147 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  67.35 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  67.35 
 
 		 149 aa  214  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  64.38 
 
 		 147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  64.38 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  61.49 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  59.18 
 
 		 151 aa  196  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  40 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  42.07 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  38.62 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  39.31 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  38.62 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.67 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.87 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  34.48 
 
 		 307 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.33 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.62 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.24 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.93 
 
 		 290 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.17 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 308 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.72 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.42 
 
 		 320 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.19 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.19 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  31.74 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.64 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.14 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.19 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.06 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.26 
 
 		 280 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.69 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.48 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.69 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.42 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.81 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  30.5 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  34.51 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  32.88 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.54 
 
 		 305 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.37 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.77 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.14 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  30.22 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  38.51 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.17 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.88 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.49 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  33.12 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.51 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.05 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.33 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.88 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  33.1 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  35.86 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.28 
 
 		 287 aa  74.7  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  37.82 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  33.1 
 
 		 303 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  30.22 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.03 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.29 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  31.79 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.65 
 
 		 300 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  31.13 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  30.12 
 
 		 515 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.47 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.93 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  30.14 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.17 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>