18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5529 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  25.62 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  23.39 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  22.26 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  23.61 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  24.73 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  21.83 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  24.83 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.63 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  23.4 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.61 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  20.86 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  21.96 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.82 
 
 		 154 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  24.22 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  23.56 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  19.5 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  21.55 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>