More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0966 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  283  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  42.86 
 
 
166 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  43.17 
 
 
143 aa  120  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  45.39 
 
 
146 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  45.39 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  43.17 
 
 
149 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  41.01 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  41.5 
 
 
145 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 
146 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  40.82 
 
 
145 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  40.14 
 
 
146 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  40 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  42.07 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  40 
 
 
146 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  40.85 
 
 
144 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  38.85 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  38.85 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  40.14 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  38.89 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  39.58 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  37.23 
 
 
140 aa  87  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.41 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.3 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.64 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.46 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.64 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  36.18 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.21 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.46 
 
 
170 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.87 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.53 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.46 
 
 
170 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  36.59 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  35.98 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  36.81 
 
 
294 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.01 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.87 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.14 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.77 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.81 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  31.54 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.66 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  31.54 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.21 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.17 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.37 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.62 
 
 
148 aa  67  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  30.61 
 
 
160 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  30.61 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.51 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.33 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
291 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  33.8 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  32 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  34.03 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.25 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.8 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.66 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.19 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.39 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  35.42 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  30.07 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02048  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  50 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00697742  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.8 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.69 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  32.19 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  31.94 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  31.94 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  32.86 
 
 
309 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  31.94 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  36.23 
 
 
627 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  31.94 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>