222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1452 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  31.72 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  31.03 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  33.1 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  31.03 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  30.34 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  30.34 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  34.25 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  30.34 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  31.47 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  31.03 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  34.25 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  30.07 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  36.49 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  34.9 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  33.33 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  28.47 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  28.47 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  28.86 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  28.37 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  28.37 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  28.37 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  28.37 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.77 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  24.48 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  28.37 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  25.69 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  26.76 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  25.87 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  26.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  26.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  26.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  26.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  26.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  26.39 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  23.78 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  26.62 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  25 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  25.68 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  25.69 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  25.69 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  27.08 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  27.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  25.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  28.37 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  23.84 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.26 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  30.77 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  25.36 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  25 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  23.97 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  25 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  26.21 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  25.68 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  27.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  27.21 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  28.66 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  27.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  27.03 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  27.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  27.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  27.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  27.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  24.16 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  27.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  27.45 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>