More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2701 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  100 
 
 
149 aa  304  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  73.83 
 
 
148 aa  221  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  59.73 
 
 
152 aa  185  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  58.39 
 
 
152 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  57.72 
 
 
152 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  54.79 
 
 
166 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  54.79 
 
 
166 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  52.05 
 
 
166 aa  163  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  52.41 
 
 
162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  49.66 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  51.68 
 
 
162 aa  144  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  51.03 
 
 
150 aa  144  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  44.83 
 
 
145 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  49.66 
 
 
147 aa  127  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  44.3 
 
 
150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  44.83 
 
 
145 aa  117  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  42.18 
 
 
146 aa  117  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  41.94 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  38.82 
 
 
154 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  39.87 
 
 
165 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.3 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.72 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  40.79 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  33.79 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.1 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  32.08 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  32.08 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  27.21 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.64 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.21 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.62 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  29.3 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  33.13 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.29 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  35.81 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.55 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  37.84 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  33.13 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.77 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.62 
 
 
280 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.79 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0180  UspA domain protein  29.05 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.242763  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.28 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.52 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  36.43 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.82 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.25 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.69 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.72 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30.82 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.41 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.1 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.46 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.1 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  31.79 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.25 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  34.01 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.08 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.59 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.38 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.81 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  31.54 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  26.83 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.29 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.08 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  28.93 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.29 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.97 
 
 
300 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  31.94 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>