More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1780 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  55.03 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  51.43 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  53.9 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  51.75 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  49.64 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  51.06 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  50.35 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  51.08 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  50.71 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  51.08 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  50 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  50.71 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  47.52 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  42.57 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  43.17 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  43.17 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  41.38 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  40.28 
 
 		 146 aa  93.2  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  40.28 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  37.06 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  36.36 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02048  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  53.62 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.25 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  30.99 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.17 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.14 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  28.87 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.76 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  27.46 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  35.97 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.14 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  34.46 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.81 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  28.97 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  29.53 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  32 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  26.14 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.88 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  28.67 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.82 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  33.11 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.1 
 
 		 180 aa  60.1  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.34 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.33 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  32.43 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  32.43 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.1 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  31.47 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.67 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.92 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  31.47 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  33.55 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  32.45 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  28.37 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  35.81 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  33.1 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.08 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  31.65 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.99 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  28.86 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  31.65 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.78 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.48 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2171  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  30 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.19 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>