More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2111 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  51.08 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  52.78 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  52.82 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  52.78 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  52.08 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  52.08 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  49.64 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  52.74 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  52.08 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  49.31 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  48.61 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  48.61 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  51.37 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  42.14 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  42.14 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  45.07 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  38.73 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  39.29 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  41.26 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  41.26 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  42.96 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  43.24 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  35.25 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  36.49 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  33.1 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  33.1 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02048  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  55.07 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.27 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  33.76 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  29.37 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  29.37 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.03 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.47 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.72 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34.48 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.97 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.97 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  28.67 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  34.69 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  31.48 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.88 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.05 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.05 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  34.39 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  31.85 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  34.39 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30.46 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  35.53 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  29.71 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.68 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.88 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.39 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.62 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  31.33 
 
 		 303 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.87 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.48 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  31.76 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.82 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  32.39 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  31.33 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.67 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  31.54 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  28.77 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  31.54 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.86 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  31.13 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  33.83 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  32.88 
 
 		 289 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  33.79 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  29.73 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2501  UspA domain protein  35.25 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.47 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>