109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2946 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  100 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  70.92 
 
 		 141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  70.92 
 
 		 141 aa  213  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  70.21 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  58.87 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  58.87 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  57.45 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  57.45 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  57.45 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  58.16 
 
 		 148 aa  175  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  56.74 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  56.74 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  50.36 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  45.39 
 
 		 189 aa  139  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  43.26 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  44.9 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  47.14 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  42.14 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  39.44 
 
 		 142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  40.14 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  33.1 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  38.57 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  38.57 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  38.57 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  38.57 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  38.57 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  34.75 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  35.71 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  35 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  35 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  35 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  35 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  35 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  35 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  35 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  32.86 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  33.8 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  28.77 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  33.1 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  31.47 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  31.03 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  30 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  26.9 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  30 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.71 
 
 		 280 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  32.39 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  29.17 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  24.48 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  28.77 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  28.08 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1446  universal stress protein UspA  29.82 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2414  UspA domain protein  29.17 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2982  hypothetical protein  25.9 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  28.46 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.9 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.58 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  30.43 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.14 
 
 		 295 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  25.49 
 
 		 155 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  27.1 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  28.97 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  24.82 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>