More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1486 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  38.85 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  38.85 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  35.25 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  35.25 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  32.39 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  32.62 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.86 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  30 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  31.47 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.04 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.51 
 
 
276 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.28 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.58 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.91 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  29.58 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  28.87 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  30.22 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  30.22 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  29.86 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  33.79 
 
 
289 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.39 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  30.94 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  28.67 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  27.86 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.94 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.94 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.57 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.03 
 
 
288 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  28.87 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.58 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  33.09 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  27.08 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.62 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.29 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.28 
 
 
307 aa  53.9  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  30.28 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  27.92 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  30.28 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  30.28 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  30.28 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
291 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  26.76 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.94 
 
 
309 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  27.54 
 
 
277 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  26.06 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.93 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.25 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  30.07 
 
 
166 aa  52  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  28.87 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  27.97 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3156  universal stress protein  30.99 
 
 
296 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2558  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
296 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  29.5 
 
 
275 aa  51.6  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  27.46 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  26.76 
 
 
180 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  26.76 
 
 
141 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  26.53 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.08 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  35 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  35 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  35 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  35 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  35 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.83 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  29.37 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  24.65 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  29.58 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 
177 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>