113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1843 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  100 
 
 		 153 aa  312  8e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  99.35 
 
 		 153 aa  310  4.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2171  UspA domain-containing protein  74.17 
 
 		 152 aa  236  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  32.67 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  32.67 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  32.67 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  33.77 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  32.26 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  29.61 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  30.67 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  29.53 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.75 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.01 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.08 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.08 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.77 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  25.85 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.86 
 
 		 314 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  27.22 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  26.32 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  26.71 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.17 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.63 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  26.06 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  26.74 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  27.2 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.05 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  25.5 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  25.66 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25.81 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  26.6 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  26.9 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  28.86 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.07 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  27.78 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  25.52 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  25.52 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  27.87 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2377  UspA domain protein  27.59 
 
 		 266 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  23.93 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  28.19 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  23.13 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 		 306 aa  44.3  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  22.44 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  29.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.62 
 
 		 290 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  25 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  27.66 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  30.19 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  27.89 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.99 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  28.1 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  28.1 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.28 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  24.16 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  23.29 
 
 		 149 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  28.1 
 
 		 164 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  23.97 
 
 		 136 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  30.07 
 
 		 140 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  22.78 
 
 		 182 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  22.78 
 
 		 182 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  26.8 
 
 		 148 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  30.12 
 
 		 278 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  26.49 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  26.49 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  27.01 
 
 		 319 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  22.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  25.32 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  36.17 
 
 		 294 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  24.32 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  26.14 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  27.01 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  24.72 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>