More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0081 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  100 
 
 
143 aa  286  8e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 
141 aa  99  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  43.15 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.51 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  37.41 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 
137 aa  94  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  39.86 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  38.78 
 
 
142 aa  92  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  39.16 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  36.36 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  39.46 
 
 
142 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  38.67 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.88 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.66 
 
 
156 aa  84.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.86 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
140 aa  84  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.21 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.42 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.05 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.87 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.48 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  38.51 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.51 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.64 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.55 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  39.46 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.57 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.47 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  33.78 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  33.78 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  31.21 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  31.21 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  33.54 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.94 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  30.87 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.41 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  33.78 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  33.78 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  33.78 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  33.78 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.33 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.92 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  34.46 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.67 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  33.33 
 
 
283 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.03 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  32.17 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.78 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.78 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.78 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.78 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.78 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.78 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32.43 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  34 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  37.06 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.78 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.21 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.66 
 
 
296 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.29 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  34.27 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  32.65 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  34.27 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  37.16 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  29.37 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.72 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  35.86 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.8 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  34.51 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>