More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0762 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  100 
 
 
148 aa  300  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  73.83 
 
 
149 aa  221  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  61.49 
 
 
152 aa  191  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  60.14 
 
 
152 aa  187  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  59.46 
 
 
152 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  59.46 
 
 
152 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  53.15 
 
 
166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  53.15 
 
 
166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  52.45 
 
 
166 aa  158  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  51.37 
 
 
162 aa  151  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  48.63 
 
 
150 aa  148  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 
162 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  47.22 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  51.37 
 
 
147 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  45.27 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.84 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
145 aa  124  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  41.06 
 
 
154 aa  116  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 
165 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.13 
 
 
164 aa  100  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  36.24 
 
 
146 aa  84  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.21 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  40.27 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.25 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  36.05 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.65 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  31.65 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.71 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.42 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.05 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.42 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  35.86 
 
 
308 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.76 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  36.18 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  29.53 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  34 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  36.18 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.69 
 
 
295 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.17 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  31.52 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.33 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.64 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  31.52 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.86 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.67 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  33.78 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
297 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.69 
 
 
290 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.87 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.87 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.17 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  38.89 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  35.57 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.33 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  32.41 
 
 
289 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.12 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.9 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.45 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  37.24 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.56 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  38.19 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.66 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  33.11 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0340  UspA family nucleotide-binding protein  34.97 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000238748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
274 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  34.03 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.66 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.22 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.25 
 
 
151 aa  67  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.94 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>