More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8721 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  100 
 
 		 166 aa  323  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  44.52 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  44.52 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0255  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  41.94 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0416  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4458  UspA domain protein  38.04 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0969362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  35.62 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.54 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  36.3 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  32.48 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  32.39 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  33.11 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  35.53 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  33.11 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  33.11 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  34.44 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  33.11 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  33.11 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  33.11 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  33.11 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.14 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  30.82 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.14 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  32.88 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  32.88 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  60.42 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  34.87 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  31.33 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.25 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  45 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  42.86 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  45.65 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  31.48 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  44.93 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  31.01 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  32.17 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  32.47 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  38.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  38.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  38.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.17 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.38 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.82 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  38.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  29.82 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  38.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  31.08 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  38.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  37.91 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  28.83 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  50.98 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  43.75 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  56.25 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 283 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  37.25 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  27.97 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  30.32 
 
 		 295 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  43.08 
 
 		 306 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  28.39 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.86 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  45.28 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  39.08 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.87 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  33.13 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  50 
 
 		 120 aa  51.2  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>