207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3100 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  100 
 
 		 292 aa  570  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  48.19 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  48.19 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  48.19 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  46.98 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  48.57 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  44.73 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  35.62 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0255  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  37.17 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  29.93 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.27 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0416  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.08 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  31.94 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  30.5 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  31.86 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  33.77 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.77 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  33.67 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  28.09 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  28.09 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  28.09 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  33.17 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.96 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.69 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  32.82 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  32.82 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  32.82 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  28.35 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.7 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.81 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  55.56 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  27.44 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  32.68 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 		 449 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.65 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 137 aa  50.1  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  27.05 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.97 
 
 		 148 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.99 
 
 		 314 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  26 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  44 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  24.84 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  32.67 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.29 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.16 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.25 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  29.22 
 
 		 154 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  35.38 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  29.68 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.45 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.28 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  35.29 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.44 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  32.66 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.54 
 
 		 144 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  29.41 
 
 		 164 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.26 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.29 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  34.44 
 
 		 164 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  31.34 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  25.63 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  34.44 
 
 		 164 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  59.09 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.6 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.65 
 
 		 187 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 142 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.93 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.93 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  29.94 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  26.49 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.35 
 
 		 140 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.08 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  27.22 
 
 		 158 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  31.29 
 
 		 138 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>