156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5002 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  100 
 
 
283 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  74.56 
 
 
283 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  52.84 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  52.84 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  52.84 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  48.57 
 
 
294 aa  225  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  46.98 
 
 
292 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  27.69 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  32.82 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.15 
 
 
300 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  21.77 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  28.83 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.08 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.51 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  32.58 
 
 
137 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.58 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.97 
 
 
293 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 
293 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  31.43 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  26.84 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  26.84 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.17 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  27.18 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  20.32 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.17 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.17 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  27.69 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 
137 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  50 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.16 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.16 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.43 
 
 
139 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 
145 aa  49.7  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  28.75 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  50 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  29.47 
 
 
308 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  25.32 
 
 
281 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  27.59 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.84 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.7 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  42 
 
 
160 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  27.27 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.58 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  25.93 
 
 
130 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  26.9 
 
 
142 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.16 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  42.86 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.53 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  21.02 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  30.14 
 
 
145 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  25.4 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
130 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  26.77 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.82 
 
 
150 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  26.73 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  40 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  52.17 
 
 
140 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  39.22 
 
 
181 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.63 
 
 
297 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.79 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  31.52 
 
 
288 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  29.9 
 
 
283 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  34.57 
 
 
157 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  42.11 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
140 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  34.57 
 
 
157 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74592  universal stress protein (USP) family protein possible involvement in nucleo-mitochondrial control of maltose, galactose and raffinose utilization  45.65 
 
 
480 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  29.49 
 
 
281 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.5 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  41.67 
 
 
145 aa  45.8  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  50 
 
 
156 aa  45.8  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  29.41 
 
 
144 aa  45.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  48.98 
 
 
125 aa  45.8  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  25.47 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.98 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.35 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>