143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1372 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  100 
 
 
283 aa  550  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  74.56 
 
 
283 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  52.13 
 
 
277 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  52.13 
 
 
277 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  52.13 
 
 
277 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  47.84 
 
 
294 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  48.23 
 
 
292 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.68 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
277 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  34.2 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.43 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.8 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  36.17 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.87 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.88 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.88 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.84 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  30.82 
 
 
166 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  29.64 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 
296 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.15 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.17 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  31.55 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
294 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.85 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  33.33 
 
 
288 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.97 
 
 
139 aa  52.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  30.21 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  38.27 
 
 
157 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  38.27 
 
 
157 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.62 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.98 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 
131 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.17 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
275 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  35.51 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 
130 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.46 
 
 
1044 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.72 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.98 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  32.6 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  30.21 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.08 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  29.39 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  28.14 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.84 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  38.27 
 
 
130 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  29.18 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.52 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.98 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  31 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  28.75 
 
 
294 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  48.98 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  41.82 
 
 
164 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  38.98 
 
 
164 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.5 
 
 
300 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 
140 aa  45.8  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  30.26 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  54.29 
 
 
143 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  30.05 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  42 
 
 
160 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.67 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  34.52 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  25.15 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.98 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.43 
 
 
177 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  26.19 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>