266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0182 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  100 
 
 
281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  75.09 
 
 
281 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  48.06 
 
 
283 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  46.13 
 
 
284 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  46.13 
 
 
284 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  45.77 
 
 
284 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  47.54 
 
 
285 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  44.84 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  47.37 
 
 
284 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  43.46 
 
 
283 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  44.88 
 
 
283 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  43.06 
 
 
285 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
283 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  41.55 
 
 
284 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  42.05 
 
 
283 aa  217  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  37.94 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  37.41 
 
 
287 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  35.69 
 
 
288 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  36.49 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  182  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  36.71 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  35.52 
 
 
287 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  35.52 
 
 
287 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  35.52 
 
 
287 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  32.98 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  33.57 
 
 
281 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  31.8 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
286 aa  139  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  30.85 
 
 
284 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  31.21 
 
 
284 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  28.72 
 
 
278 aa  132  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  29.79 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  25.34 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.91 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  22.94 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.31 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.94 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  36.46 
 
 
126 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.94 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.23 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  25.69 
 
 
272 aa  62.4  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  23.23 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  24.66 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.85 
 
 
140 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  23.41 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.84 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  27.81 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  24.42 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  22.94 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.46 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  25.76 
 
 
147 aa  55.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 
140 aa  55.8  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  24 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  25.86 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  23.85 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.68 
 
 
150 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25.71 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  24.02 
 
 
415 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.94 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.64 
 
 
128 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.26 
 
 
151 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  24.71 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  27.68 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.01 
 
 
164 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
271 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.47 
 
 
150 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  29.69 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.38 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  29.66 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  21.73 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  26.76 
 
 
147 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.74 
 
 
150 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  28.19 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.36 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.01 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  24.04 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.15 
 
 
152 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 
157 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  48 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  34.92 
 
 
120 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  28.21 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  21.49 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  24.46 
 
 
144 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.48 
 
 
136 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  24.04 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.9 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  36.51 
 
 
141 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.82 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  27.46 
 
 
155 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  32.23 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  34.33 
 
 
140 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  40 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  27.61 
 
 
140 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>