More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1659 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  100 
 
 
147 aa  293  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  64.79 
 
 
142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  43.24 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  45.45 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  47.92 
 
 
145 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  43.79 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  43.15 
 
 
145 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  46.48 
 
 
150 aa  119  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  46.81 
 
 
144 aa  115  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  43.75 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  42.14 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  40.62 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  44.14 
 
 
140 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  43.06 
 
 
144 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  42.03 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  44.9 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  43.17 
 
 
138 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  45.32 
 
 
138 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  43.57 
 
 
137 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  41.01 
 
 
136 aa  103  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  45 
 
 
140 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  39.73 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  41.96 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  41.67 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  41.55 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  40.14 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.36 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  41.06 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  37.58 
 
 
295 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  42.86 
 
 
290 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  40.54 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.1 
 
 
304 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.75 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.66 
 
 
153 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  39.16 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  39.16 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  37.86 
 
 
176 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  40 
 
 
307 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.14 
 
 
180 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
297 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  37.14 
 
 
295 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  35.62 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.19 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.29 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.93 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  36.11 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  42.36 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.55 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.61 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.57 
 
 
280 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  38.46 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.57 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  39.61 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.66 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.67 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.9 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.96 
 
 
159 aa  76.6  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  34.51 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  39.74 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.97 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.86 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1965  UspA domain protein  35.42 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.19 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.41 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  34.27 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.85 
 
 
297 aa  74.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.03 
 
 
207 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.2 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3734  UspA domain protein  37.14 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  34.27 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.03 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.11 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  37.06 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.62 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  33.8 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  41.84 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.92 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.33 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35.14 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  33.1 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  35.66 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.56 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.33 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  36.11 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
274 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.3 
 
 
320 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  34.04 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>