44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3734 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3734  UspA domain protein  100 
 
 
153 aa  297  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1965  UspA domain protein  66.46 
 
 
161 aa  193  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  41.13 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  37.14 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  39.07 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  37.14 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  35.86 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  33.57 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  35.42 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  33.57 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  35 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  35.17 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  32.19 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.97 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  36.55 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  35.86 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  32.54 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.25 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  33.11 
 
 
149 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  35.97 
 
 
295 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  34.38 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  28.95 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  30 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  30.71 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  37.5 
 
 
307 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  32.26 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  37.06 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  31.03 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  32.86 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  30.77 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  35.17 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
449 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  32.14 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  43.9  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.21 
 
 
140 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  35.37 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  37.93 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  29.79 
 
 
140 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  24.82 
 
 
280 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  25.17 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  25.17 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0609  UspA domain protein  24.64 
 
 
273 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.65 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>