More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3438 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  291  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  76.39 
 
 
145 aa  231  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  46.43 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  46.81 
 
 
142 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  44.3 
 
 
149 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  46.81 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  47.52 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  44.44 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  43.15 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  42.03 
 
 
138 aa  105  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  45.89 
 
 
150 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  40.54 
 
 
145 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  39.44 
 
 
142 aa  100  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  42.25 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  46.43 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  41.26 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  43.42 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  40.28 
 
 
142 aa  94  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  38.19 
 
 
295 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  44.06 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  39.72 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  41.84 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  43.8 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  40.28 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  40.74 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  40.88 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  43.97 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  40.71 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.13 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  38.52 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  37.5 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  38.1 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  38.62 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.69 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  39.58 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.41 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  36.08 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.5 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.48 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  40.41 
 
 
290 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.17 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.5 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  34.78 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  38.19 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  34.78 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  39.16 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.05 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.05 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.01 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32 
 
 
449 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.09 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.88 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  36.13 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  36.43 
 
 
208 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.25 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.21 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  36.43 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  51.35 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.05 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.76 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.23 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.18 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.17 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.55 
 
 
305 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.56 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  33.79 
 
 
281 aa  67  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.07 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.33 
 
 
288 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  35.97 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.64 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  31.29 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  31.29 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  34.44 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  36.88 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  34.48 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  33.33 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  35.17 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  35.17 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  34.75 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.57 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  35.71 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>