147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1018 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  100 
 
 
277 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  100 
 
 
277 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  52.84 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  52.13 
 
 
283 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  54.21 
 
 
294 aa  232  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  48.19 
 
 
292 aa  205  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  36.14 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  33.95 
 
 
166 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  29.84 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  28 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  31.55 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0255  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 
162 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0951611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  32.63 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  29.84 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  31.08 
 
 
172 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
172 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
171 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  30.73 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  26.37 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.97 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  28.73 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  27.83 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  29.56 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0416  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
161 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  30.9 
 
 
273 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 
293 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  29.69 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.13 
 
 
321 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  35.96 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.66 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  29.91 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.7 
 
 
164 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.66 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.66 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.32 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
141 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  33.18 
 
 
302 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  29.65 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 
289 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.38 
 
 
297 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  29.39 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  37.17 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.82 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.38 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.98 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  29.22 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.3 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.73 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  27.4 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  31.58 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  29.11 
 
 
281 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 
295 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  29.81 
 
 
164 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.73 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  26.7 
 
 
303 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.53 
 
 
289 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.25 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  49.02 
 
 
151 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  28.77 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  30.23 
 
 
130 aa  45.8  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  25.87 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  31.46 
 
 
180 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.33 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.37 
 
 
140 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  28.48 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.12 
 
 
147 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.98 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  28.65 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  43.48 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  32.41 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0709  UspA domain protein  30.37 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457079  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  31.84 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  25.61 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>