206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2785 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  45.77 
 
 		 284 aa  244  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  44.72 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  44.91 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  44.68 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  41.99 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  44.17 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  39.58 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  39.58 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  39.58 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  44.37 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  41.05 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  38.73 
 
 		 283 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  36.49 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  31.8 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  37.5 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  34.95 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  33.69 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  32.99 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  34.39 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  34.95 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  34.71 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  28.82 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  27.68 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  26.19 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  25.09 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  23.59 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.07 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  35.39 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  29.91 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  30.7 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  32.46 
 
 		 126 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  31.18 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  26.65 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.82 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.05 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  31.91 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.89 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  29.84 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  20.27 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  29.53 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  27.81 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  29.67 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.8 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.8 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.03 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  29.09 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  24.58 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.8 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  33.11 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  27.82 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.67 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 449 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  27.57 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  25.91 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  32.72 
 
 		 149 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  27.24 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  29.82 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  28.99 
 
 		 140 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.23 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  26.87 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  27.69 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.64 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  32.52 
 
 		 150 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  27.51 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  27.8 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  29.25 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  29.57 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  27.23 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  27.84 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.85 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  25.56 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  30.69 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  25.24 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  26.42 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>