218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1227 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  89.44 
 
 		 284 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  89.44 
 
 		 284 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  81.69 
 
 		 285 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  59.51 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  57.54 
 
 		 284 aa  315  7e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  50.35 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  47 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  45.77 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  48.59 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  48.58 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  48.24 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  45.42 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  50.35 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  47.37 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  38.16 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  36.71 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  36.71 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  36.71 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  38.52 
 
 		 286 aa  188  7e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  38.68 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  38.73 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  39.08 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  38.03 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  37.54 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  37.28 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  35.79 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  30.14 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  29.33 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  28.98 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  32.76 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  23.63 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.99 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.99 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  30.49 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.51 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  28.16 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  29.61 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.05 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.72 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.86 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  32.17 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  28.08 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  30.34 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  28.22 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.89 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  29.05 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  31.06 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  30.07 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  33.56 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  29.44 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  26.98 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  26.97 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  25.74 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  26.32 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  30.71 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  29.33 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  23.68 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  29.89 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  28.38 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.63 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  27.01 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  27.96 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  31.08 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  29.2 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  28.18 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  26.23 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  31.07 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  31.78 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.19 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  30.19 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  28.92 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  22.81 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 130 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  29.05 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  25.25 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  27.07 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.95 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>