40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2042 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  97.54 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  61.75 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  30.85 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  30.14 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  27.87 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  29.89 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 		 312 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  26.07 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  28.33 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  29.79 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  25.7 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  25.7 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  25.7 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  26.15 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  26.6 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  25.62 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  28.27 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  26.22 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  26.22 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  23.57 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  23.49 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  23.53 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  22.97 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  26.74 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  23.32 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  21.55 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  22.14 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  23.57 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.31 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  22.62 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  31.4 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>