More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4142 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  100 
 
 
281 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  95.73 
 
 
281 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  82.92 
 
 
281 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  48.75 
 
 
283 aa  258  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  46.81 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  45.04 
 
 
284 aa  238  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  39.64 
 
 
285 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 
284 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  44.17 
 
 
283 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 
284 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 
283 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 
284 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  35.94 
 
 
283 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 
284 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  42.46 
 
 
288 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 
285 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  42.11 
 
 
288 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
283 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  37.1 
 
 
287 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  37.1 
 
 
287 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  37.1 
 
 
287 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
283 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  33.57 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  39.22 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  35.69 
 
 
284 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  33.1 
 
 
287 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  34.04 
 
 
286 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  37.37 
 
 
283 aa  149  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  34.29 
 
 
281 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  26.32 
 
 
286 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  27.15 
 
 
281 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  25.44 
 
 
278 aa  99  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  23.32 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  22.97 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  23.96 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  21.91 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  31.69 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  33.33 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.25 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  32.84 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.66 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.96 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  33.93 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  33.78 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.41 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  21 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.47 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  29.94 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.94 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  27.41 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.55 
 
 
297 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  31.76 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
271 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  32.65 
 
 
570 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  24.83 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  32.22 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  35.95 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  33.11 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.16 
 
 
128 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.22 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  28.08 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  31.41 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  31.67 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  31.41 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  40.26 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  41.27 
 
 
157 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  28.43 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  50.98 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  28.76 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  30.89 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  34.87 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
324 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2280  UspA12  27.75 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  26.97 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.97 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  33.09 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  27.24 
 
 
277 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  31.65 
 
 
136 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.22 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 
172 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  33.56 
 
 
278 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  35.8 
 
 
140 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
279 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 
279 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  29.91 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>