60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0174 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  593  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  62.46 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  61.75 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  31.36 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  31.1 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  29.58 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  32.16 
 
 		 281 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  33.57 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  33.45 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  24.56 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  27.66 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  25.96 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  25.96 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  25.96 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  26.13 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  28.67 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  24.83 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  22.89 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  24.3 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  27.87 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  24.48 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  22.92 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  23.96 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  24.31 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  20.91 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  22.86 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  27.21 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  26.83 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  32.64 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  25.12 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  31.09 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  22.78 
 
 		 162 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  27.52 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.84 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  22.45 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  32.93 
 
 		 279 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  33.33 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  30.89 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0709  UspA domain protein  30.85 
 
 		 140 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  27.11 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  23.56 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 		 141 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  24.16 
 
 		 157 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  27.7 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>