177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  100 
 
 		 284 aa  557  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  54.58 
 
 		 283 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  49.65 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  50.35 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  49.12 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  47.37 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  45.07 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  46.67 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  45.42 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  48.4 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  41.55 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  42.81 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  41.55 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  41.55 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  41.55 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  39.44 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  38.81 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  38.75 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  38.16 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  35.92 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  36.14 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  37.81 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  35.69 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  36.49 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  25.96 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  28.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  28.27 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  26.39 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25.34 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  31.88 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.58 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  26.76 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  27.02 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  29.7 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  32.6 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.18 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.97 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  30.13 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  33.68 
 
 		 126 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  52.94 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  30.33 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  29.19 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  31.33 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  33.33 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.92 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  33.33 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  29.73 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.06 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  53.33 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  20.6 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  25.08 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.94 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  29.61 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  32.89 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  27.98 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  27.75 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  27.98 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.62 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  31.17 
 
 		 120 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  31.62 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  33.08 
 
 		 136 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  28.76 
 
 		 570 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.27 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  28.95 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  31.33 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  44.68 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  26.42 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  26.56 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  28.49 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  27.98 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  26.67 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  30.26 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  28.83 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  26.67 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  27.93 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  25.3 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  30.92 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  27.32 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>