130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1702 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  32.87 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.44 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.3 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  26.22 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  29.05 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  25.26 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  26.32 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  28.69 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  36.05 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  26.82 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  29.05 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  25.96 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  27.81 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  30.5 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  34.25 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  30.3 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  29.05 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  22.49 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  25.94 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  28.57 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  32.16 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  27.02 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  33.55 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  29.25 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  32.19 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  25.71 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  26.22 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  27.06 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  25.1 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  25.1 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  27.21 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  27.68 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  26.92 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  27.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  25.47 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.94 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  25.44 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  24.05 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  29.58 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  30.56 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.34 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  29.87 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  23.57 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  24.75 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  24.8 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.63 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  27.09 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  25.88 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  26.92 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  28.51 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  25.75 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  25.58 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  39.22 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  23.87 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  23.87 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  28.03 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  23.87 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  23.65 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  29.77 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  27.73 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  24.38 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  27.6 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  27.59 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  28.76 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  27.73 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  30.66 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  20.71 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  31.08 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  27.22 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  30.19 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  22.89 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>