More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2814 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  100 
 
 
148 aa  294  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  33.12 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  35.22 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  32.39 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  34.31 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
297 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  35.71 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 
297 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.94 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.17 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  47.69 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  30.82 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.94 
 
 
291 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.94 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.81 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.12 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.92 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  36.96 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.64 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  31.85 
 
 
294 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.53 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  32.62 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  30.14 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.16 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  30.82 
 
 
319 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  30.82 
 
 
315 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  30.82 
 
 
315 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.64 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  30.63 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.12 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 
449 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  31.76 
 
 
144 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  35.11 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  36.26 
 
 
146 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.86 
 
 
140 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  37.41 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  43.08 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.03 
 
 
200 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  38.51 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  32.62 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  30.5 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  31.85 
 
 
271 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
275 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  32.39 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.14 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  28.38 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.67 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  30.46 
 
 
317 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  33.56 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  32.39 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.17 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.79 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.99 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  26.62 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.71 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  36.49 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3285  UspA domain protein  34.07 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.86 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.03 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  29.58 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.99 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  29.79 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  31.39 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  29.2 
 
 
287 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  51.02 
 
 
280 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  33.79 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  41.94 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  29.5 
 
 
283 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
300 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>