More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0206 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  100 
 
 
143 aa  285  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  31.47 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  31.58 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  34.44 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.56 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.66 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  33.57 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  33.57 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  33.33 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  33.57 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.29 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.47 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  33.57 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  33.57 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  33.57 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  33.57 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  33.57 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.54 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.67 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.37 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.28 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.14 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.95 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.67 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.54 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  27.95 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.28 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  29.71 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  32.41 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.9 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  31.58 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  29.17 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  30.34 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  30.34 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  25.77 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.34 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  28.3 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.45 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.69 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  26.71 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.4 
 
 
300 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  29.45 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.66 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  55.56 
 
 
292 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  29.11 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  33.8 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.69 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  28.57 
 
 
315 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  48 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.37 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.94 
 
 
294 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  28.19 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  33.11 
 
 
303 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  27.45 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.34 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  28.57 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  28.08 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.46 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  28.28 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
274 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  28.57 
 
 
315 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  27.89 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.46 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  30.46 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  28.97 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.86 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.95 
 
 
314 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  27.59 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.43 
 
 
284 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>