More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5077 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  100 
 
 		 156 aa  310  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.9 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.11 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  30.5 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.41 
 
 		 303 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  46.97 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  54.72 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.43 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  32.89 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.74 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.33 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.29 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  30.3 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.36 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  49.09 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  30.3 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  38.55 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  32.21 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  32.21 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  27.08 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  33.33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  46.15 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.05 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  31.65 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1014  UspA domain protein  35.24 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  43.56 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  28.29 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.07 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  32.19 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  28.85 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  30.14 
 
 		 308 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  50 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  33.57 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.79 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.59 
 
 		 297 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.29 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  42.86 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.31 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  30.87 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  42.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  29.05 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  42.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  42.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  31.51 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  42.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  42.31 
 
 		 310 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  50.94 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  42.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 278 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.18 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  50 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  34.25 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.77 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.18 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  32.17 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  30.52 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.29 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  48.08 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  41.79 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  50 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.81 
 
 		 317 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.07 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  30.2 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.94 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.54 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 290 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  43.08 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 289 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.07 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  30.46 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  37.66 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.61 
 
 		 308 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  30.14 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  33.57 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.95 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 279 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  43.64 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>